抗原的基本性质具有 异物性、大分子性和特异性。（1）、异物性是指进入机体组织内的抗原物质，必须与该机体组织 细胞的成分不相同。抗原一般是指进入机体内的外来物质，如细菌、病毒、花粉等；抗原也可以是不同物种间的物质，如马的血清进入兔子的体内，马血清中的许多蛋白质就成为兔子的抗原物质；同种异体间的物质也可以成为抗原，如 血型、 移植免疫等；自体内的某些隔绝成分也可以成为抗原，如眼睛水晶体蛋白质、 精细胞、 甲状腺球蛋白等，在正常情况下，是固定在机体的某一部位，与产生抗体的细胞相隔绝，因此不会引起自体产生抗体。但当受到外伤或感染，这些成分进入血液时，就像异物一样也能引起自体产生抗体，这些对自体具有 抗原性的物质称为 自身抗原，所产生的抗体称为 自身抗体。由于自身抗体与自身抗原发生反应，于是就引起自身免疫疾病，如过敏性眼炎、 甲状腺炎等。机体其它自身组织的蛋白可因电离辐射、烧伤、某些化学药品和某些微生物等理化和 生物因素的作用发生变性时，也可成为自身抗原，引起自身免疫疾病，如 红斑狼疮病、白细胞减少病、慢性肝炎等。（2）、大分子性是指构成抗原的物质通常是 相对分子质量大于10000的大分子物质， 分子量越大，抗原性越强。绝大多数蛋白质都是很好的抗原。为什么抗原物质都是大分子物质呢？这是因为大分子物质能够较长时间停留在机体内，有足够的时间和 免疫细胞（主要是 巨噬细胞、 T淋巴细胞和 B淋巴细胞）接触，引起免疫细胞作出反应。如果外来物质是小分子物质，将很快被机体排出体外，没有机会与免疫细胞接触，如大分子蛋白质经水解后成为小分子物质，就失了抗原性。（3）、特异性是指一种抗原只能与相应的抗体或 效应T细胞发生特异性结合。抗原的特异性是由分子表面的特定化学基团所决定的，这些化学基团称为 抗原决定簇。抗原以抗原决定簇与相应 淋巴细胞的抗原受体结合而激活淋巴细胞引起 免疫应答。换言之，淋巴 细胞表面的 抗原识别受体通过识别抗原决定簇而区分“自身”与“异己”。抗原也是以抗原决定簇与相应抗体特异性结合而发生反应的。因此，抗原决定簇是免疫应答和免疫反应具有特异性的物质基础。